Bağırsak hazırlığı, bağırsak temizliği yada kolon temizliği, başlıca bağırsakların dışkıdan arındırılması amacı ile gerçekleştirilir. Bağırsak hazırlığı: kolonoskopi, kalın bağırsak röntgeni, sanal kolonoskopi, kapsül endoskopisi, ince bağırsak röntgeni ve bağırsak ameliyatları öncesinde uygulanır. Bağırsak hazırlığı için sodyum fosfat, müshil ilaçları, elementer diyet, bağırsak yıkama, polietilen glikol (PEG) ve mannitol kullanılmaktadır. Bu müshil ilaçlarının kramp şeklinde karın ağrıları, bulantı, kusma ve baş dönmesi gibi yan etkileri olabilir.